可是妖族在神族的压迫之下已无安居之所，他们请求灵羲趁机杀了相伴身侧的云曜，以削神族之势，来给妖族争取一线翻盘之机。看着流离六界的妖族，灵羲答应了。

大婚那日，云曜耗尽法力为灵羲治好了眼睛，却被妖族趁虚而入，最后，他几乎死在了灵羲手中，神族亦是被妖族重创，元气大伤。

妖族终于重新在六界之中找回了一席之地，而灵羲已全身为妖族之义，早就决定此番之后，云曜若生，她便再不问六界中事，永生永世与他相伴；云曜若死，她便随他而去，消散于天地之间。

然而云曜虽未彻底灰飞烟灭，但他的神体几乎毁灭，不得不下界轮回历劫，唯有渡劫成功，才能再登神位，否则便要彻底消失在六界之中。

灵羲只得在栖凰殿中等待他归来，她无法窥得云曜渡劫之天机，无法知晓云曜是生是死，只有漫长而无尽的等待，日复一日，饱尝相思之苦。

她也曾下界寻找过他，希望知道他是否安好，但茫茫人海，就算她能够一眼认出他，天机也会让他们永远地错过。

在下界，她无意间听来了一首叫《葛生》的乡间歌谣，“冬之夜，夏之日，百岁之后，归于其室。”

自己不正如这人间歌谣所唱吗？没有他的日子，时光是如此的漫长难捱，夜夜都是冬天寒冷的夜，天天都是夏日炎热的天。可若是真的能够如凡人一般，百年之后与他在黄泉相聚就好了，但自己却连他的生死都不知。

一万年过去了，云曜还是没有归来，她日日担忧着他的安危、他的生死，渴盼着他的归来，可是他仍旧音信全无。适逢妖界内乱，需要一位强大的妖平定、震慑，以还妖界秩序与安宁，而这个人在妖族眼中，非灵羲莫属。

日夜的等待是无期的，妖族的内乱却是迫在眉睫，灵羲不得不再度出世主持妖界大局，妖界上下将她奉为妖祖，面对混乱的妖界，她也必须强硬起来。

白日里，她是果决强势、雷厉风行的妖祖。然而，她的心里却住着一个软弱的灵羲，夜里回到栖凰殿，歌唱着那首《葛生》，等待着爱人归来。

而在灵羲的心里，也在挣扎着，有一个声音不停地在说：“别等了，他不会回来了，他已经死了，已经灰飞烟灭。”

她想“竹本无心，无心不伤”，要是自己没有心就好了，和云曜既做敌人又□□人的这些年，就不必这么煎熬痛苦了。没有心，便也能安然地做这妖祖，不必在这漫长无期的等待中挣扎。

就在这等待与煎熬之中，在这漫长的岁月之中，她似乎变成了另一个人，从温柔到强势，从如莲荷般柔软的灵羲变成了如烈火却无心的妖祖。

又过了万年，云曜终于历劫归来，然而灵羲却不再是当初的灵羲。她以为，他爱的是过去的她，但现在的她已经面目全非，她恐惧着他不再爱她的样子，而在他离开的日子里，她选择了做这妖祖，又是与他再度对立，于是，她离开了栖凰殿，回归妖界。

此后，帝君与妖祖回归各界，在之后的数万年里，执掌各族、两相对立、分庭抗礼。