另一名叔父郑鸿达私放敌将马得功，更是罪无可恕。郑鸿达自知此事隐瞒不了多久，写了一份认罪书，向郑成功自首坦白了：叔父此举罪无可恕，却情非得已，只因那马得功以我一家老小做要挟……

郑成功对此解释可以理解，决定不再追究，却无法原谅，于是命令手下：定国公若造访，便和他说，本帅不想见他！

郑芝莞在海上避难了数日，得知郑成功回防，清军撤退，竟恬不知耻地重回厦门。他自知罪孽深重，却自恃郑家宗亲，笃定郑成功不敢处置自己。

四月初十，郑成功召开军法会议，公开审判罪将。他肆意宣泄自己的怒火，诸将噤若寒蝉。有人求他从宽处置，他怒斥：“你给郑芝莞说情，莫不是想给自己今后临阵脱逃铺路？”

此言一出，再没人敢置喙。郑成功下达了最终判决：以尚方宝剑，斩罪将郑芝莞！

尚方宝剑是天子赐予心腹之臣的信物，象征着天子的信任，和“斩奸佞”的责任。

“老夫何罪至死，何罪至死啊！”郑芝莞连连喊冤，但已于事无补。他当场被处斩，船上的财宝全部没收充公。

郑芝莞的首级被曝尸三日，才准许入土。守城失职的阮引、何德各领了五十杖刑。《闽海纪要》有曰：诸将股栗。

同时，据《台湾外纪》记载，郑成功布告全军：

本藩铁面无情，尔诸勋臣镇将，各宜努力。苟不能进怯敌，本藩自有国法在；虽期服之亲，亦难宥之。

此布告一出，再加之郑芝莞已服刑，全军上下无不震惊于首领的“铁面无情”。处置完罪将后，郑成功造访曾樱府，郑重悼念这位忠直的老人。

郑鸿达心中有愧，为表自责之意，主动让出金门岛，退到了对岸的白沙。白沙等沿岸部分区域仍是郑家的势力范围。郑鸿达将麾下兵马尽数交给郑成功，再无起兵造反之力。他想以此打消郑成功的疑虑，让其消气。

此番清军偷袭厦门，郑成功因其失策和用人不当，也难辞其咎。但他补救得当，以“铁面无情”的做派让全军重振了士气。据《闽海纪要》记载：“兵势复振。”

同年，在北京清廷，有人告发已故的摄政王多尔衮曾密谋造反，其派系下的官吏遭朝廷肃清。

皇太极临死前，将年幼的顺治帝托付予亲弟多尔衮和堂弟济尔哈朗。但事实上，多尔衮一人成功将统治权攥在手中，他在世期间，比他年长的济尔哈朗根本没有话语权。眼下，济尔哈朗终于荣升郑亲王，为报复多尔衮对自己多年的打压，捏造了其谋反的罪证。

就这样，已入土的多尔衮惨遭追夺封典、毁墓掘尸，但世人都知其冤枉。直到乾隆四十三年（1778），他才得以平反。