洪承畴到达南京之后的种种措秩，商毅在杭州也都了解得十分清楚。

以前清军有一个很大的弱点，就是江北、江南指挥不统一，虽然阿济格和多铎是亲兄弟，不致于互相拆台，但毕竟没有一个全权负责的人，江北、江南往往都是各自为战，也给了商家军从容应对的机会。而现在阿济格北返，洪承畴和多铎都在南京坐镇，清军也形成了一个统一的指挥部，这样一来江北、江南协同作战的情况也就会多了起来，以后的战事将更加复杂。

不过商毅当然不会等着清军全部准备好之后，再来打自己。自从商家军在江北攻取了滁州、和州之后，双方都己经歇战了一个多月的时间，而商毅也抓紧这段难得的宝贵时间，初步完成了浙江地区商家军的扩军编制，现在驻守浙江地区的商家军第一军和第三军。

扩编之后，第一军包括有五个师、三个旅，总兵力超过七万；第三军有两个师、三个旅，含一个骑兵师和一个特种旅，总兵力也达到了四万二千。兵器配置率也达到了百分之八十左右。基本的作战部队都保证有武器。

而且隶随于海军的长江舰队也己经初步组建完毕，由海军的副军长兼任长江舰队的总指挥官。新组建的长江舰队一共有战舰九十四艘，士兵五千余人，基地设在长江入海口的通州附近，设有三个分舰队：

第一分舰队：指挥官何滨，包括有三级巡洋舰二艘，四级驱逐舰三艘，五级护卫舰八艘。五百料以下战船八艘。三百料以下战船十艘。主要是付责在长江入海口至南京段江面作战。

第二、三分舰队：指挥官易吉轩、南亚虎，分别包括有四级驱逐舰二艘，五级护卫舰五艘。六百料以下战船十艘。三百料以下战船十五艘。主要是付责深入长江中游江面作战。

虽然现在还不是收复南京的时机，但江南地区的商家军己经做好了充分的准备工作，完全可以主动向清军发动进攻，趁着现在清军正在整编，还没有作好充份的应战准备的时，先在南京周边地区打几个胜仗，逐步清扫南京的外围，不仅可以歼灭清军的有生力量，同时也是为年底复夺南京做好充份的准备。

因此商毅也决定，这一次出兵分为南北两线、同时向清军发动进攻。

南线由成进领军，出动第一军的三个师、两个旅，共计四万五千兵力，进攻广徳州，攻击南京的南面。而北线则是水旱两路齐进，由杨武丞领军、出动第三军的一个师、两个旅，共计二万五千兵力，进攻镇江府。而黄镇也率领长江舰队出击，从江面上支援作战，攻击南京东面。

广徳州是从南京进入杭州府的必经之路，而镇江更是南京东面的门户，离南京不足百里，如果能够顺利的取下这两处地方，那怕只攻下一处，商家军也就可以在江南战场上取得一定的主动权，复夺南京的困难也就会小得多了。